Une nouvelle recherche du Département d’informatique biomédicale (DBMI) de la faculté de médecine de l’Université du Colorado a identifié 45 gènes dont l’expression génique est associée à l’indice de masse corporelle (IMC), dont beaucoup n’ont pas été explorés dans la recherche sur l’obésité avant, après avoir mené une étude utilisant une cohorte multiethnique. Leur étude, « Gene Expression Associations With Body Mass Index in the Multi-Ethnic Study of Atherosclerosis », publiée dans le Journal international de l’obésité, pointe vers de nouveaux biomarqueurs potentiels de l’obésité. Cela a été accompli en puisant dans les données d’une vaste cohorte diversifiée qui a été initialement rassemblée en 2000.
« Jusqu’à présent, peu d’études génétiques sur l’IMC ont été menées dans des cohortes ancestrales diverses », explique l’auteur principal Luciana Vargas. « La nouveauté de notre étude est l’utilisation de données d’expression génique directement mesurées. »
Vargas, un doctorant de la CU School of Medicine qui s’intéresse à la médecine personnalisée, affirme que ces associations de gènes connues et nouvelles peuvent fournir des informations sur la biologie de l’obésité, les biomarqueurs potentiels et les cibles thérapeutiques.
Pour leur étude, les chercheurs des laboratoires DBMI d’Ethan Lange, PhD, et de Leslie Lange, PhD, ont exploité les données de l’étude multiethnique de l’athérosclérose (MESA). Lors de son lancement, MESA a recruté plus de 6 000 personnes, recrutées dans six centres de terrain à travers le pays, pour rechercher les facteurs de risque et les premières caractéristiques des maladies cardiovasculaires. Les participants continuent de se présenter périodiquement aux centres de terrain pour la collecte de données sanitaires. En raison de la grande population d’étude diversifiée sur le plan ethnique et de la quantité d’informations sur la santé recueillies, les chercheurs ont utilisé ses données pour une multitude d’études. Le consortium Trans-Omics for Precision Medicine (TOPMed) financé par le National Heart, Lung, and Blood Institute, qui a été lancé en 2014, a commencé à recueillir des données sur l’expression génique et d’autres données « omiques » sur un sous-ensemble de participants MESA, ainsi que sur des participants de nombreux autres cohortes.
« Nous avons utilisé la cohorte MESA car il est vraiment difficile de trouver une cohorte bien définie avec beaucoup de bonnes mesures cliniques, d’obtenir le financement et de maintenir le contact avec les participants à l’étude pour collecter du sang et faire ces études au fil du temps », explique Iain Konigsberg. , PhD, instructeur de recherche en informatique biomédicale qui travaille avec Vargas au DBMI Lange Lab.
Les chercheurs ont analysé les données de séquençage de l’ARN de quatre groupes raciaux et ethniques auto-identifiés dans la cohorte MESA – Afro-américain, Américain chinois, Hispanique et Blanc – pour évaluer l’association d’expression de chaque gène pour un effet sur l’IMC. De nombreuses caractéristiques liées au risque cardiovasculaire sont également pertinentes pour l’obésité, ce qui rend la cohorte MESA idéale pour la recherche sur l’obésité.
Les 45 gènes qu’ils ont identifiés avaient des expressions associées à l’IMC dans les quatre groupes. Alors qu’un petit nombre de ces gènes ont été identifiés grâce à des études d’association génétique, les auteurs de l’UC ont signalé de nombreuses nouvelles associations.
Konigsberg affirme que leurs travaux soulignent la nécessité d’une plus grande diversité dans la recherche sur l’obésité et s’attend à ce que les résultats de cette étude éclairent d’autres études en aval. Il prévoit de poursuivre ses recherches en utilisant MESA et d’autres cohortes humaines. Cela a été une leçon précieuse de recherche collaborative pour Vargas, qui a commencé ses études à CU Anschutz à l’automne 2021 en tant que doctorante dans le programme de génétique médicale et génomique humaine. Il s’agit de son premier article en tant qu’étudiante diplômée et membre du Leslie Lange Lab.
« S’impliquer dans le consortium TOPMed qui avait recruté des milliers de personnes à travers les États-Unis a ouvert de nouvelles opportunités de recherche », dit-elle. « J’apprécie vraiment le pouvoir de la collaboration. »
*’Les omiques font référence aux différences ou changements mesurables dans les molécules biologiques, telles que les gènes, les métabolites, les protéines et l’ARN.
