Les chercheurs renforcent la compréhension de l’univers du virus à l’aide de l’extraction de métatranscriptome


Une équipe de chercheurs de la National Library of Medicine (NLM) et des instituts de recherche universitaires collaborateurs ont découvert de nouveaux bactériophages à ARN, des virus qui attaquent les bactéries, faisant progresser la compréhension de l’évolution des virus. Les résultats ont été publiés dans la revue Cellule.

Les virus sont considérés comme les entités biologiques les plus nombreuses et les plus diverses sur Terre, et les chercheurs en ont une compréhension limitée. L’avènement de la métatranscriptomique – c’est-à-dire le séquençage de l’ARN total dans un échantillon provenant d’un environnement particulier – aide les chercheurs à découvrir des caractéristiques importantes du virome de l’ARN terrestre. Dans cette étude, les chercheurs ont identifié une Crumpa de nouveaux virus qui donnent un aperçu de la diversité, de la gamme d’hôtes et de l’évolution des virus à ARN.

Les chercheurs ont extrait plus de 5 150 métatranscriptomes divers à partir de référentiels existants et découvert 2,5 millions de séquences dérivées de virus à ARN. Cette expansion correspond à une multiplication par cinq de la diversité connue des virus à ARN. Selon les auteurs de l’étude, bon nombre des virus découverts sont vraiment nouveaux, n’ayant qu’un lien lointain avec des virus déjà connus. Deux groupes de virus les plus inhabituels forment de nouveaux embranchements potentiels et d’autres sont classés en de nombreuses nouvelles classes et ordres.

« La découverte la plus notable est l’augmentation spectaculaire du nombre et de la diversité des virus infectant les bactéries qui représentent une fraction beaucoup plus importante des virus à ARN que nous ne le pensions auparavant », a déclaré Eugene. V. Koonin, PhD, co-auteur de l’étude et chercheur principal de la branche de biologie computationnelle du programme de recherche intra-muros du NLM.

Selon les auteurs de l’étude, la vaste collection de nouveaux génomes de virus à ARN donne un aperçu de l’évolution des virus à ARN et devrait constituer une ressource majeure pour la virologie à ARN.

Source de l’histoire :

Matériel fourni par NIH/Bibliothèque nationale de médecine. Remarque : Le contenu peut être modifié pour le style et la longueur.

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