Depuis l’arrêt de Buffy contre les vampires, Eliza Dushku continue de travailler dans l’audiovisuel mais surtout en étant productrice. Comme elle le confiait dans un article du Time , elle a repris l’école et vit à quelques rues de l’endroit où elle a grandi à Boston, où sa famille habite toujours, et où elle élève son fils. Cette ancienne enfant-star qui avait pris part au mouvement #MeToo suit donc toujours des études supérieures, sur le féminisme.
Par le passé, Eliza Dushku a été la compagne du basketteur Rick Fox. Depuis juin 2017, elle est la fiancée de l’homme d’affaires Peter Palandjian. Après un mariage survenu le 18 août 2018, ils s’apprêtent désormais à accueillir leur deuxième enfant.